Forensic DNA Typing

Forensic DNA Typing

Prima mea întâlnire cu John M. Butler a fost acum 8 ani. Era un item al unei bibliografii. Deși cochetasem și înainte cu Genetica Judiciară, când l-am văzut acolo nu mi s-a părut cu nimic deosebit căci nu-mi era cunoscut nici numele și nici cartea. Asta poate și pentru ca ne aflam în 2003 iar cartea care l-a făcut celebru în domeniul geneticii judiciare – “Forensic DNA Typing” fusese publicată în 2001. Șansele ca în doi ani de la publicare o carte de specialitate să ajungă în librăriile din România erau practic infime pentru acea perioadă, așa că ignoranța mea era cumva justificată…

Așadar… un rând într-o bibliografie… la un examen pentru ocuparea unui post… un rând între multe altele și defapt cel mai important dintre toate.

Examenul l-am luat. Munca am început-o… Rândul s-a transformat în manual folosit în perioada de tutelă, apoi, în timp, manualul s-a transformat în biblie… Prin acest ultim termen înțelegând cartea de căpătai a oricărui inițiat în Genetica Judiciară, pe care după ce o stăpâneai bine, o puteai folosi pe post de sperietoare în orice dispută colegială care se încheia adesea cu un “scrie și în Butler!…”

A doua mea întâlnire cu Butler a fost sub forma unui autograf pus pe un pliant care făcea reclamă unei platforme automate de manipulare a lichidelor (cu care lucram de zor în acea perioadă), adus de niște colegi mărinimoși de la un grup de lucru ENFSI, unde au avut prilejul sa-l întâlnească pe deja faimosul Butler. Evident asta n-ar fi însemnat mare lucru într-un alt context… însă începi să apreciezi valoarea unei cărți de specialitate și implicit a omului din spatele ei, când ai tendința firească de a lucra mai mereu cu ea… în așa fel încât ajungi într-o buna zi să-ți conştientizezi faptul că universul tău profesional ar fi fost cu mult mai dificil fără o bază, clar explicată de un pedagog adevarat, mai ales într-un domeniu apreciat de mulți ca fiind fascinant dar greoi.

Și uite așa un om contemporan cu mine, aflat la mii de km distanță, rostindu-i numele aproape săptămânal, folosindu-l în articole, cursuri și prezentări, câutându-l și urmărindu-i activitatea științifică… mi-a devenit în timp mai familiar decât mulți colegi din departamentele alăturate…

A treia întâlnire cu Butler a fost cea mai palpitantă. În aprilie 2011, mă aflam la o conferință care avea loc în Bruxelles. Într-una din pauzele de cafea am observat ca lobby-ul hotelului se umplea cu mai mulți oameni decât încăpeau în sala de conferințe. Întrebând în stânga și în dreapta mi s-a spus că în paralel mai are loc o altă conferință, undeva într-o sala alăturată. N-am avut timp să mă interesez prea mult de conferința soră, căci hop îl recunosc pe Butler (evident, din poze).

Aia era șansa mea… Vânez clipa în care rămâne singur… mă duc la el… îi întind mâna… mă prezint… și înainte să fie anunțată reînceperea inopinată a prelegerile celor două conferințe, îmi calc în picioare orgoliul juvenil și îl rog să facă o poză cu mine… Omul foarte politicos de fel, probabil obișnuit cu astfel de manifestări, a acceptat fără ezitare. Apoi fiecare și-a văzut de ale lui.

me_and_butler

La finele primei zile de prelegeri, m-am retras în camera de hotel pentru a mă schimba cu ceva mai lejer, având în gând să merg și să-mi petrec restul zile pe străduțele din centrul Bruxelles-ului, mâncând gofre cu de toate și ciocolată fel-de-fel…

Nu m-am îndepărtat prea mult de Sheraton (hotelul la care fusesem cazat), când deodată în fața mea îl văd pe Butler venind dinspre centru. Părea total dezorientat, puțin dezamăgit și oarecum cu capul în nori…

L-am salutat când am ajuns în dreptul său, gândind că cel mai probabil nu-și va mai aminti de mine… însă surpriza mi-a fost mare, căci am realizat că se bucura oarecum să vadă pe cineva cunoscut. Din vorbă în vorbă mi-am dat seama că era prima lui călătorie la Bruxelles și că ieșise sa-şi facă “siesta” vizitând orașul, însă ne-cunoscându-l, nu avusese curajul să se aventureze prea departe… Iar ceea ce văzuse în mica lui escapadă, nu-l impresionase prea tare…

M-am oferit să-i fac un tur al principalelor atracții din centrului Bruxelles-ului… și iar surpriză… era și mai încântat de idee…

Evident, pe tot parcursul călătoriei noastre am vorbit vrute și nevrute…. de la modul în care eu și colegii mei am ajuns să învățam după cartea/cărțile lui… până la lucruri mai personale precum prietenii și familiile noastre. Amândoi eram fascinați unul de celalalt… eu căci aveam ocazia să vorbesc cu un mentor… el probabil pentru că îi ofeream un feed-back sau o perspectivă europeano-balcanică… pe care nu avusese ocazia să o cunoască cu alte ocazii în care vizitase Europa.

Forensic DNA Typing a fost publicată în 2001 la editura Elsevier Academic Press. A urmat o a doua ediție în 2005, apoi autorul a hotărât (cu acordul soției care i-a tolerat de-a lungul timpului apucăturile pedagogice), să idă cartea inițială în trei volume:
2010 – Fundamentals of Forensic DNA Typing
2012 – Advanced Topics in Forensic DNA Typing: Methodology
2014 – Advanced Topics in Forensic DNA Typing: Interpretation

fundamentals advanced_methodology

 

Și pentru că Butler și-a acceptat de la bun început rolul de evanghelist al acestei științe aplicate numită Genetică Judiciară, majoritatea materialelor din cărțile sale sunt reînnoite permanent și puse la dispoziție gratuit publicului larg pe website-ul propriu numit sugestiv Short Tandem Repeat DNA Internet DataBase.

2nd international congress on research of rare and orphan diseases

It is a pleasure to announce the 2nd international congress on research of rare and orphan diseases to be held at the Gehry building on the Novartis Campus in Basel, Switzerland, from 5th to 8th March 2014 a superb setting for stimulating learning, exchanges and networking.

CONGRESS

In its first edition, the RE(ACT) Congress brought together almost 300 people to discuss research into rare diseases and the development of active substances to treat them. What made the congress unique was the interdisciplinary collaboration. Scientists from different disciplines – stem cell researchers, geneticists, biochemists, clinicians and pharmacists – exchanged information with patient organizations.

CONGRESS GOALS

  • Promote research on rare and orphan diseases among the general public, industry and policy makers
  • Bring together researchers and their knowledge
  • Helping the understanding of other more common diseases
  • Encourage clear insights positions identifiable from the scientific community in university and industry

MAIN TOPICS

  • Stem cell and cell therapy approaches
  • Mapping diseases and genome instabilities
  • Pathophysiology and diagnostics
  • Bringing treatments to the clinic
  • Degenerative disorders
  • Regulatory Affairs and Patients in Research

SCIENTIFIC DISCIPLINES INVOLVED

Autoimmunity, biochemistry, cell biology, dermatology, endocrinology, gastroenterology, gene therapy, human genetic, hematology, infectious diseases, inflammation, molecular and cellular biology, neuroimmunology, oncology, orphan drugs, pathology, pharmacology, primary immune deficiency, rheumatology, transplantation, virology.

Useful links:

Conferința de Medicină Personalizată

Conferința de Medicină Personalizată

personal_genetics_confPersonal Genetics a organizat marți, 3 septembrie 2013, orele 09:30, la Hotelul Howard Johnson București, sala Platinum Grand Ballroom conferința „Medicina Personalizată – Noi perspective pentru pacientul român” – un proiect amplu dedicat exclusiv domeniului Sănătății și Cercetării din România. [link]

Link-uri utile: Agenda conferinței

 

 

8th ISABS Conference on Forensic, Anthropologic and Medical Genetics and Mayo Clinic Lectures on Translational Medicine

8th ISABS Conference on Forensic, Anthropologic and Medical Genetics and Mayo Clinic Lectures in Translational Medicine, Split, Croatia, June 24 – 28, 2013 is next in the series of biennial events organized by the International Society for Applied Biological Sciences (ISABS), a society dedicated to the promotion of applied molecular biology (www.isabs.hr).

The program for 2013 includes:

Forensics Genetics
New Perspectives in Human Forensic Molecular Biology
Archaeological Genetics
Genetic Genealogy
Advanced Methods for Forensic Practice
Forensic Science in Disaster Management
Crime Scene Investigation
Genomics in Medicine
Pharmacogenomics and Drug Development
Stem Cells in Medicine
Genetic Modification for Cancer Immunotherapy
Advances in Regenerative Medicine
NextGen Sequencing for Human Identification
Captured Next-Gen Sequencing for Deciphering Rare Monogenic Diseases
New Paradigms of Clinical Trials
Ribosomes in Medicine
Future of Glycobiology

Together with several notable conference regulars, next year will bring many new names including Nobel Prize laureates Aaron Ciechanover, Robert Huber and Ada Yonath.

www.isabs.hr

Phenotypic traits

Inspired by the phenotypic traits of one of his offspring and also by the single photo that survived over time, the artist Ion-Aurelian Badulescu reconstructed the 3D model of “Neacşu” a Romanian peasant born in 1895…

ADN, o probă scumpă, dar greu de combătut

Publicat pe digi24.ro la 05-12-2012 20:32

În dosare extrem de complicate, precum cel al Elodiei, de crime sau jafuri armate, foarte importante sunt expertizele ADN. De câteva luni, specialiștii care fac analizele au la dispoziție unul dintre cele mai moderne laboratoare din Europa de Est. Deși expertizele genetice sunt de multe ori decisive, anchetatorii nu le pot cere prea des. Sunt foarte costisitoare, iar Ministerul de Interne nu are destui bani.

O picătură de sânge, un fir de păr, o urmă de salivă sau de piele. Oricare dintre acestea pot ajuta la identificarea genetică a unei persoane. Adică găsirea ADN-ului, acel CNP genetic unic pentru fiecare om.

„Șansa ca 2 profile genetice să fie identice și să aparțină a două persoane diferite este de 1 la mai multe ori populația umană de pe Terra. Adică, imposibil”, a explicat Florin Stanciu.

Doctorul Florin Stanciu este unul dintre cei mai experimentați specialiști în expertiza ADN din România. A făcut mii de analize. Pentru un indiciu concludent, nu este de-ajuns întotdeauna o singura probă. Exemplu, cazul Elodiei, dar și multe altele.

Profilele ADN găsite la locul crimei sau jafului sunt comparate cu cele ale suspecților. Când se suprapun, polițiștii știu că au cazul rezolvat. Ofițerii trebuie să aibă de multe ori instinct.

De pildă, în 2005, polițiștii de la Omoruri au ridicat probe de salivă de pe cojile de semințe găsite în casa unui bărbat ucis. Ochiul format al ofițerului i-a spus că victima era mult prea ordonată pentru a arunca mizeria în mijlocul casei. Specialiștii au identificat profilul ADN iar polițiștii au căutat printre suspecți până au găsit o potrivire.

„Am început audierea în zonă și după un an și jumătate am găsit un suspect căruia i s-au prelevat și lui probe pentru ADN și rezultatul a fost pozitiv”, a povestit subcomisarul Marian Mihoci.

A durat atât de mult pentru că baza de date cu ADN-uri avea informații puține. Şi astăzi, după mari progrese, doar 16 mii de date se regăsesc în sistemul informatic, iar asta îngreunează mult anchetele.

De exemplu, în acest moment, polițiștii din Capitală caută un pedofil considerat extrem de periculos. A violat o fată de șapte ani, în apropierea unei școli, iar expertiză genetică a arătat că tot el e suspectul principal în cazul unui alt viol, tot cu victimă minoră, din 2009. Doar că atunci, profilul lui ADN nu a fost introdus în baza de date.

„În condiții optime ar trebui să cerem de fiecare dată expertize ADN, însă, intervine inconvenientul financiar și anume soluțiile necesare pentru prelucrarea acestor probe ADN sunt relativ scumpe”, a spus inspectorul principal Adrian Obadă, de la Serviciul Omoruri.

„O probă se situează ca și cost undeva la 100 de euro”, a explicat doctorul Florin Stanciu.

Așa se face că în România, doar în cazurile considerate grave se fac expertize. Şi nu de fiecare dată.

De pildă, în cazul lui Nicolae Vlad, trimis în judecată pentru uciderea studentei japoneze, la marginea Capitalei, polițiștii nu au avut bani pentru o expertiză genetică atunci când el a fost suspectul principal în mai multe violuri. Fără astfel de probe, judecătorii l-au lăsat în libertate și astfel a putut să o ucidă pe Yurika Masuno.

8th Y chromosome / 5th EMPOP workshop

6-8 September 2012, Innsbruck, Austria

The motto of the upcoming meeting is “Exploring the Phylogenies”. Haploid markers are inherited along a phylogeny and leave genetic footprints in modern populations. The incisiveness of the picture depends on the history of these populations. Forensic scientists are taking advantage of the derived patterns in their daily work, e.g. by assigning geographical landscapes to lineages or by performing quality control of datasets. Our database projects YHRD and EMPOP are currently preparing for new releases that help scientists and practitioners to better understand and employ the underlying phylogenetic principles.

www.yhrd.org
www.empop.org

Building a minimalist DNA database management system using Pruem instruments

Stanciu F. 10th International Symposium on Forensic Sciences. Journal/ Book of Articles, Bratislava 2011, p.151-156.

Abstract:

When it comes of DNA data exchange base on 2008/615/JHA and 2008/616/JHA Council Decisions, each EU country is free of choosing the implementation means. Romania has some experience in implementing three different types of IT solutions: a bought one – Dimensions 2.0, an in-house built solution – Pruem tools and a freeware solution – CODIS 7.0, each of them with their specific advantages and disadvantages. Starting with the Pruem DNA data exchange infrastructure and base on Pruem tools any DNA database laboratory, which has some Pruem DNA data exchange experience, can build from scratch a simple DNA database management system for laboratory internal DNA profiles comparison purposes, with a minimum of human and IT resources. This paper presents a review of the Romanian National DNA Database Laboratory efforts in building a minimalist DNA database management system using the most common and freely available Pruem tools: Communication component (Germany), Match engine (Austria) and Graphical user interface (Netherlands).

Keywords: Pruem DNA data exchange, Pruem tools, DNA database management system, Romanian National DNA Database Laboratory.

10th International Symposium on Forensic Sciences

27-30 September 2011 10th International Symposium on Forensic Sciences, Bratislava, Slovakia

Stanciu F.

Building a minimalist DNA database management system using Pruem tools (poster)

Abstract:

When it comes of DNA data exchange base on 2008/615/JHA and 2008/616/JHA Council Decisions, each EU country is free of choosing the implementation means. Romania has some experience in implementing three different types of IT solutions: a bought one – Dimensions 2.0, an in-house built solution – Pruem tools and a freeware solution – CODIS 7.0, each of them with their specific advantages and disadvantages. Starting with the Pruem DNA data exchange infrastructure and base on Pruem tools any DNA database laboratory, which has some Pruem DNA data exchange experience, can build from scratch a simple DNA database management system for laboratory internal DNA profiles comparison purposes, with a minimum of human and IT resources. This paper presents a review of the Romanian National DNA Database Laboratory efforts in building a minimalist DNA database management system using the most common and freely available Pruem tools: Communication component (Germany), Match engine (Austria) and Graphical user interface (Netherlands).

Keywords: Pruem DNA data exchange, Pruem tools, DNA database management system, Romanian National DNA Database Laboratory.

[download]

GenoStat

GenoStat is a forensic DNA analysis java-based application that generates DNA profile match statistics (RMP, CPI and things like sibling match probabilities) as well performing mixture resolution (separating mixtures into their contributor components).

http://www.bioforensics.com/genostat/

Forensic Bioinformatics 9th Annual Conference. Forensic DNA in the Courtroom

On 12 and 13 August 2011, Dan Krane and Keith Inman will be presenting a full-day DNA workshop in St. Croix and St. Thomas (U.S. Virgin Islands). The workshop is an opportunity for attorneys of all experience levels to learn about the implications pertaining to forensic DNA profiling results. The seminar will cover subjects germane to forensic DNA including: evidence collection, quality assurance, validation of laboratory procedures, serology, transfer, identification, technical artifacts and error, DNA database searches, juror comprehension, expert witness selection, and due diligence. The workshop will also include a hands-on component to familiarize the participants with the processes involved with forensic DNA profiling. Course materials consisting of speaker presentations and supporting references such as key literature, legal documents and web sites will be provided to each participant in electronic format at the beginning of the seminar. There are no admission restrictions.

http://www.bioforensics.com/conference10/index.html

7th ISABS Conference in Forensic, Anthropologic and Medical Genetics

ISABS wishes to invite you to join us at the 7th ISABS Conference in Forensic, Anthropologic and Medical Genetics, Bol, Island of Brač, Croatia, June 20-24, 2011. This event will feature the latest advances in forensic genetics, molecular medicine and related areas. Just as importantly, it will be a forum for exchange of pertinent information, ideas and technical developments in the form of lectures, technical hands-on workshops, round-table discussions and poster presentations.

www.isabs.hr

4th Medical Genetic Romanian Association Conference

18-20 September 2008 – 4th Medical Genetic Romanian Association Conference, Craiova, Romania.

a)  Stanciu F, Sevastre O, Tinischi M, Stoian V.

Valorificarea reziduurilor biologice obţinute in urma analizelor medicale pentru studii de Genetica Forensica (poster)

Abstract:

În situații deosebite în care recoltarea de probe biologice de referință este imposibilă prin metodele clasice, analizele medicale efectuate în laboratoarele de screening, respectiv reziduurile biologice obținute în urma efectuării acestora, pot furniza date genetice valoroase cu aplicabilitate in genetica forensică. În acest sens am evaluat o serie de reziduuri in componența cărora pot exista celule nucleate pretabile genotipării, urmărind factori precum timpul și condițiile de păstrare ale probelor biologice în laboratoarele medicale, degradarea ADN-ului, prezența contaminării, rata succesului calculata la numărul de loci amplificaţi, etc.. Am efectuat izolarea totală a ADN-ului folosind o forma adaptata a protocolului AGOWA mag DNA Isolation Kit pentru platforma automată de manipulare a lichidelor Freedom EVO 150. Din extractele de ADN obținute au fost amplificați 16 markeri STR folosind AmpFlSTR Identifiler PCR Amplification Kit. Ampliconii au fost analizați prin electroforeza capilară folosind analizorul ABIPrism 3100. Rezultatele obținute au fost interpretate folosind GeneScan și Genotyper Software conform standardelor specifice analizelor de genetica forensică.

[download]

b) Duta-Cornescu G, Stoian V, Constantin N, Simon-Gruita A, Stanciu F, Banica D, Tuduce R, Cristea P.

Genetic Studies about TB Susceptibility in Romanian Population (poster)

Studies on the association between VDR gene polymorphisms and susceptibility to tuberculosis in the Romanian population

6th European Cytogenetics Conference (6th ECC). 7-10 July, 2007. Istanbul-Turkey. Chromosome Research (2007). pp.258. Poster 13.1-P

V. Stoian, N. Constantin, A. Simon-Gruita, F. Stanciu, G. Duta-Cornescu, D. Banica, R. Tuduce and P. Cristea

University of Bucharest, Faculty of Biology, Institute of Pneumophtiziology M. Nasta, Bucharest, University Politehnica of Bucharest

Abstract:

Epidemiologic and laboratory studies suggest a correlation between vitamin D metabolism and immunity to TB; single nucleotide polymorphism (SNP) on vitamin D receptor (VDR) gene seems to influence in certain ethnic groups the host response to Mycobacterium tuberculosis. VDR gene located on chromosome 12 (12q12-14) has 15 exons span on approximately 75 kb. The goal of our study is to find out whether VDR gene variants are associated in the Romanian population with the susceptibility to TB. The case-control study carried out on TB patients and healthy control group tries to identify two VDR gene polymorphisms, defined by the restriction endonucleases ApaI and TaqI. For VDR genotyping, PCR-RFLP and ARMS-PCR methods were used. With the first method a 740 bp amplified DNA fragment is subjected to the restriction enzyme digestion. The second method uses sequence specific primers to amplify the four haplotypes generated by ApaI and TaqI polymorphisms. Thus, wild and mutant alleles (A, T and a, t respectively) and the corresponding genotypes (AA, Aa, aa and TT, Tt, tt) were identified. The results were statistically analyzed to determine the possible association between these polymorphisms and sensibility/resistance to TB in the Romanian population. Preliminary data show that the wild allele A frequency in TB patients (0,64) is greater than in control group (0,56), but allele T frequency is approximately equal in both groups (0,61 in patients and 0,60 in control). The genotype frequencies revealed the heterozygote predominance for ApaI polymorphism with a higher value registered in TB patients (0,64 and 0,52 respectively). For the TaqI polymorphisms the TT genotypes were better represented in TB patients (0,77) than in the control (0,43) but exceeded the frequencies of the other genotypes. For further development of the study a comparison regarding the correlation between these polymorphisms and TB susceptibility in different geographic zones of Romania will be done.

The allelic frequencies analysis of two protein markers and several DNA-STR markers in human populations

Duţă-Cornescu G, Stoian V, Stanciu F, Simon-Gruiţă A, Rodewald A. Proceedings GSP 2005 – International Workshop on Genomic Signal Processing; p.143-148.

Abstract:

The genetic discipline cannot be uncoupled from bio-statistics, the tools to handle and analyze the large amount of data that are obtained from DNA, RNA and protein projects. The mathematics and bio-statistics give the genetic researcher the possibility to understand the genetic data, to interpret and to obtain maximum results from minimum data. The human race is characterized by variability, by polymorphisms. A polymorphism is a mendelian character which is present in at least two phenotypes in population, from which none is rare (i.e. none appears with a frequency lower then 1% – 2%). At the beginning the protein polymorphisms were used in population genetic studies, but there relatively low variability and the need of large amounts of biologic material made them hard to use in large scale genetic analysis. In 1978 the first DNA polymorphism was discovered (the B – globin gene). After that a cascade of types of DNA markers came, RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), VNTR (Variable Number Tandem Repeats) and STR (Short Tandem Repeats), and the analysis of the genetic structure of human populations became easy, the challenging part for a biologist being now the interpretation, the formulation of an equation in which all the data to be present This was possible by creating a mathematical model, a representation of the biological processes, in which both observed laboratory data and expected data are described in quantitative way.
In this paper, the authors present a large picture of how mathematics and statistic help a researcher to give a meaning of his genetic observation. We used the polymorphism of two proteins (Haptoglobin and Transferrin) and two STR – DNA markers to make a population survey and to compare the genetic structure of Romanian population with other European and non-European population. The data were interpreted in statistical method, under Hardy-Weinberg condition, using X tests. Also, using several other STR DNA markers and math methods we exemplify bow linkage analysis can be a powerful tool for prenatal diagnostic of different genetic disorders and for finding new genes.

Forensica 2008

25-26 April 2008 – Forensica 2008, Praque, Czech Republic.

a) Stanciu F, Stoian IM, Popescu OR.

Evaluation of Freedom Evo 150 with AGOWA sep9600 for Databasing Purposes (poster)

Abstract:

Automation is crucial nowadays in databasing laboratories especially in those countries which are relative new in the field and must quickly reach the minimum standards of consecrated databasing laboratories from Europe and USA. In our efforts to build Romanian National DNA Database we evaluated the Freedom Evo 150 Liquid Handling Platform with Agowa 9600 Magnetic Separator in different running conditions and flux implementations, for reaching the most efficient ones. We compared the results with those obtained from manual extraction methods such as magnetic DNA extraction and Chelex DNA extraction. For this we used a total of 6246 biological reference samples (5220 – automated DNA extraction and 1026 – manually DNA extraction), which we amplified using AmpFlstr Identifiler Kit. The obtained PCR products had been analyzed by capillary electrophoresis using ABI Prism 3100 Genetic Analyzer.

Keywords: automation, databasing laboratory, liquid handling platform, DNA magnetic separator

[download]

b) Stoian MG, Galan E, Stanciu F, Ciofu V.

Comparative Study of Soils from Several Romanian South-East Regions and their Influence on DNA Degradation in Tooth Samples, From Different Periods of Time (poster)

Abstract:

The degradation process of tooth and bone tissues and also of the DNA from them is a very complex one, determined by many concurrent factors which can be classified in three main categories – biological, physical and chemical factors. This paper presents our research regarding morphological aspects of soils and the influence of chemical composition on DNA degradation through fossilization process. In order to achieve our goals, we collected 27 soil samples from different archaeological sites, from various depths and different archeologically periods of time – Neolithic, The Bronze Age, The First Iron Age, The Romano-Byzantine Age, VIII-X century. We performed pH determination, calcination losses, SEM/EDS analysis of soil samples and we correlated our results with the DNA degradation index obtained from fossilized tooth samples collected from the same locations as soils. The results obtained from this analysis represent a small part of our efforts in reaching out the main objectives: a) establishing the identification and differentiation criteria for forensic soils; b) establishing which types of soil better preserves the human DNA from teeth and bones for further genetic analyses.

Keywords: Soil, Fossilization, Teeth, DNA degradation index

[download]

[visit the official website]

Genotipare Umană în Biocriminalistică şi Paleogenetică

gubp

Stanciu F, Stoian D. 2006, 162 p., Editura Semne. ISBN 973-624-368-0

CUPRINS

Capitolul 1. Introducere în studiul geneticii judiciare şi al paleogeneticii umane
1.1. Scurt istoric
1.2. Genetica judiciară
1.3. Paleogenetica umană
1.4. Limite şi diferenţe ştiinţifice între genetica judiciară şi paleogenetica umană

Capitolul 2. Particularităţi ce ţin de natura probei biologice de provenienţa a extractului de ADN
2.1. Prelevarea şi păstrare probelor biologice
2.2. Surse de ADN uman
2.2.1. Sângele
2.2.2. Sperma
2.2.3. Urina
2.2.4. Saliva
2.2.5. Ţesuturi ale organelor interne
2.2.6. Ţesutul tegumentar
2.2.7. Ţesutul osos
2.2.8. Ţesutul dentar
2.2.9. Firul de păr
2.2.10. Alte potenţiale surse
2.3. Variaţii cantitative ale ADN-ului
2.4. Factori şi procese ce concură la degradarea probelor biologice, respectiv a acizilor nucleici
2.4.1. Factori degradatori ante-mortem
2.4.2. Factori degradatori post-mortem

Capitolul 3. Markeri genetici
3.1. Definirea conceptului de marker genetic
3.2. Clasificarea markerilor
3.3. Scurtă introducere în metodele şi tehnicile de identificare ale markerilor moleculari ADN, utilizate în paleogenetica umană şi biocriminalistică
3.3.1. Izolarea ADN-ului
3.3.2. Restricţia enzimătica
3.3.3. Analiza spectofotometrică şi fluorometrică
3.3.4. Electroforeza
3.3.5. Hibridizarea moleculara (Sothern Blotting)
3.3.6. Reacţia de polimerizare în lanţ (PCR)
3.3.7. Secvențierea
3.4. Markeri moleculari ADN uzitaţi în studiile de genotipare umană
3.4.1. Introducere în studiul microsateliţilor (STR)
3.4.2. Markeri moleculari ADN mitocondriali
3.4.3. Markeri moleculari ADN nucleari

Capitolul 4. Aspecte finale ale studiilor de genetică judiciară şi paleogenetică umană
4.1. Autenticitatea rezultatelor
4.1.1. Surse de contaminar
4.1.2. Eliminarea contaminării
4.1.3. Validarea rezultatelor
4.2. Utilitatea markerilor moleculari în studiile de paleogenetica umană şi biocriminalistică
4.2.1. Arbori filogenetici şi ceasurile moleculare
4.2.2. Diagnostic post-mortem
4.2.3. Profilul fenotipic
4.2.4. Identificare de persoane
4.2.5. Testul de paternitate
4.3. Considerente etice ale studiilor de genetică judiciară şi paleogenetică umană
4.4. Predicţii cu privire la evoluţia metodelor de studiu în biocriminalistică şi paleogenetică umană.

Capitolul 5. Norme şi legi
5.1. Valoarea probatorie şi atribuirea profilului ADN în Criminalistică
5.1.1. Atribuirea profilului ADN
5.1.2 Baze de date ADN
5.2. Metoda identificării profilului ADN – mijloc de probă
5.2.1. Probaţiunea în procesul penal pe baza profilului ADN
5.2.2. Metoda identificării profilului ADN – mijloc de probă în procesul civil
5.3. Reglementari internaţionale privind investigaţia criminalistică pentru identificare pe baza profilului ADN
5.3.1. Reglementari în legislaţia SUA privind identificarea biocriminalistică a profilului ADN
5.3.2. Reglementări în legislaţia europeana privind identificarea biocriminalistică pe baza profilului ADN
Bibliografie
Anexe

5th ISABS Conference in Forensic Genetics and Molecular Anthropology

5th ISABS Conference in Forensic Genetics and Molecular Anthropology

03-07 September 2007 –  5th ISABS Conference in Forensic Genetics and Molecular Anthropology, Split, Croatia.

a) Stanciu F, Potorac R, Veronica Stoian V.

Indirect approach in finding someone’s autosomal genetic profile – a forensic tool in investigating historical cases (poster)

[download]

b) Stanciu F, Galan E, Stoian MG, Andreescu G, Soficaru AD, Miriţoi N.

Comparative study of several tooth samples from different archaeological sites and the implications of fossilization in preservation of DNA overtime (poster)

[download]

[visit the official website]

Pagina 2 din 212